HDF5形式の木構造を以下に示す。
媒質番号(Dataset, int, nx*ny*nz )
差分格子(Group)
x方向格子座標ベクタ(Dataset, float, nx )
y方向格子座標ベクタ(Dataset, float, ny )
z方向格子座標ベクタ(Dataset, float, nz )
媒質データ(Group)
媒質キー(Dataset, integer, nm)
媒質パラメータ(Dataset, float, nm*4)